- Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi Bölümü
- Bilim ve Teknoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi (YUBİTAM)
- Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi
- Kadın ve Aile Araştırmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi (YÜKAM)
- Girişimcilik ve İşletmecilik Uygulama ve Araştırma Merkezi (YÜGİM)
- Dış İlişkiler Koordinatörlüğü (YUDİK)
- Türk Dili Bölümü
- Sürekli Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi (YÜSEM)
- Enformatik Bölümü
- Uluslararası Çatışma Çözümleri Uygulama ve Araştırma Merkezi (YÜÇAM)
- Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi
- İş Sağlığı ve Güvenliği Birimi
- Merkez Araştırma Laboratuvarı (YÜMERLAB)
- Kalite Koordinatörlüğü
- Engelli Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Yalova Üniversitesi Türkçe Öğretimi Uygulama ve Araştırma Merkezi (YTÖMER)
